O Programa de Pós-graduação em Ciências Farmacêuticas surgiu da necessidade da região centro-oeste e sul do estado do Paraná por cursos de pós-graduação que proporcionem o aprimoramento de recursos humanos em pesquisa, especialmente nas áreas de Farmácia e de Análises Clínicas.
O curso de Mestrado Acadêmico, do tipo associação ampla entre a Unicentro e a UEPG, foi autorizado pelo Conselho Técnico-científico da Educação Superior (CTC-ES) da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes) em 02 de outubro de 2009, com nota 3.
O curso de Doutorado Acadêmico, do tipo associação ampla entre a Unicentro e a UEPG, foi autorizado na 160ª reunião do CTC-ES, realizada no período de 19 a 23 de outubro de 2015, com nota 4.