O processo de elaboração do Plano de Desenvolvimento Institucional, PDI, para o quinquênio 2009-2013 foi confiado à Pró-Reitoria de Planejamento, PROPLAN, que, a partir de 2007, iniciou os trabalhos de ausculta e envolvimento de toda a comunidade universitária na construção do documento.
Ao longo de 2008, a Comissão para Estudos e Elaboração do PDI, composta de representantes das Pró-Reitorias, Setores de Conhecimento, Direções de Campi, Agentes Universitários e membros dos Diretórios Centrais de Estudantes, estudou e propôs, em conjunto com a comunidade acadêmica, prospecções para o quinquênio 2009-2013, que se materializaram em políticas, diretrizes e ações para as áreas de ensino, pesquisa, extensão e gestão da Unicentro.