Manejo de Florestas Naturais:
Esta Linha de Pesquisa desenvolve atividades de ensino e pesquisa relacionados à dinâmica da floresta e o manejo dos ecossistemas naturais, com ênfase na fitossociologia, dinâmica, desenvolvimento de modelos de crescimento, ingresso e sobrevivência, regeneração, mapeamento e monitoramento, proteção florestal, genética e melhoramento, silvicultura urbana, energia de biomassa, e tecnologia de produtos florestais.
Manejo de Florestas Plantadas:
Esta Linha de Pesquisa desenvolve atividades de ensino e pesquisa relacionados ao gerenciamento e a tecnologia dos plantios florestais, abordando as áreas de solos e nutrição, genética e melhoramento, silvicultura, biometria, modelagem do crescimento e produção, planejamento, colheita e logística, proteção florestal, biomassa e carbono, ergonomia, energia de biomassa, e tecnologia de produtos florestais.